У 1963-1965 роки в Архангельському соборі Кремля вироблялося розтин гробниць царя Івана Грозного та її синів - Федора та Івана. Сам Іван Грозний ще за життя заповідав поховати себе в дияконника вівтаря - святині собору, мабуть, бажаючи підкреслити свою особливу роль першого російського царя-самодержця. Зверху гробниці Івана Грозного знаходиться зроблений на початку XX століття мідний кожух з чохлом та ім'ям, під ним - цегляна надгробок, під ним - вирубаний із цільного вапняку саркофаг, напівкруглий у узголів'я і кілька розширюється відповідно до положення плечей покійного. Саркофаг закритий білокам'яної плитою, на якій красивою в'яззю XVII століття зроблено напис - ім'я похованого і дати його життя і смерті. Поруч - саркофаги його раніше похованого сина Івана та сина Федора. Це були останні представники роду Івана Калити, що правили Руською землею протягом 300 років. Будинок Калити пишався своїм родоводом, яку вони виводили від легендарного Рюрика; в 1598 році зі смертю царя Федора Іоанновича рід цей перервався ...
Багато подій з життя Івана IV, стан його здоров'я в останні роки і причина смерті досі неясні, хоча написано про це дуже багато. Історики свого часу навіть сперечалися про дату смерті грізного царя, так як літописи досить бідно говорять про те, що цар помер 19 березня 1584. А Псковський літопис називає датою його смерті 18 березня. Перш останню дату вважали помилковою, але на надгробній плиті саркофага зазначений саме день 18 березня: Іван Грозний помер до вечора, і звістка про його смерть поширилася тільки на інший день.
Помер він раптово, в нападі люті, яку навмисне викликав один з його наближених. У «Записках» англійського дворянина Д. Гарсея сказано, що за грою в шахи (або шашки) Іван Грозний раптом «ослаб і повалився навзнак. Відбулася велика замішання і крик, одні посилали за горілкою, інші - до аптекарям ... за духівником і лікарями. Тим часом цар віддав духа і задубів ».
Над померлим самодержцем був здійснений обряд постригу, на труп наділи чернечу схиму і нарекли покійного Іоною. Так була виконана воля Івана Грозного, який бажав прийняттям чернечого сану спокутувати гріхи, а гидоту свого життя.
Розтин царської гробниці велося в наукових цілях, щоб по черепним кістках відновити вигляд Івана Грозного, тому брали участь у ньому співробітники кремлівських музеїв, Інституту судово-медичної експертизи та інших наукових установ під керівництвом М.М. Герасимова - археолога, антрополога і скульптора. У результаті дослідження з'ясувалося також, що і раніше робилися спроби розкрити царські гробниці, чому ліва ступня Івана Грозного була зачеплена. Але ким і коли це було зроблено - зараз точно сказати неможливо.
Схима, в якій поховали Івана IV, за чотириста з гаком років настільки зотліла, що при щонайменшому дотику до неї розсипалася, а місцями збереглися тільки її контури по швах. Вилучати таку «одяг» вченим доводилося, лише підкладаючи під неї щільні аркуші паперу. У саркофазі знаходилася велика кількість гумусу (чорно-бурого порошкоподібного тліну), що містить частинки тканини шати і дрібних тканин покійного. Череп царя був злегка повернуть вліво, його фундаменти, а ліва скронева кістка виявилися крихкими і легко кришилися. Незвично розташовувалися кістки правого передпліччя: вони були зігнуті в області ліктьового суглоба таким чином, що кінці пальців як би стикалися з нижньою щелепою ... В основному ж кістки скелета Івана Грозного збереглися досить добре, і вчені, судячи з ним, прийшли до висновку, що цар мав великою фізичною силою.
У узголів'я саркофага стояв скляний кубок з густою рідиною жовто-бурого кольору і щільною масою на дні. У цій масі (як і у гробах синів Івана Грозного) вчені виявили хітинові скелети мух і жуків-турунів, які могли заповзти в негерметично закриті саркофаги. Особливо прекрасної роботи був блакитний кубок, який стояв в одному з кутів саркофага. Невідомі були ні місце, ні час виготовлення цього кубка, ні привід або подія, з якими він був зв'язаний. І почалася копітка робота вчених щодо встановлення історії кубка, який представляє собою склянку на ніжці загальною висотою 18 сантиметрів. Розписаний він золотом та емалями в чотири кольори (червоний, жовтий, зелений та білий). Саме скло кубка синє - прозоре в середній частині і ледь просвічують внизу.
У результаті досліджень було встановлено, що кубок пов'язаний з придворною майстерні Рудольфа II - спочатку ерцгерцога Австрійського, а потім імператора Священної Римської імперії. Мабуть, це був подарунок, оскільки зв'язку Івана Грозного і Рудольфа II були дуже живими і тісними, особливо під час підготовки до переговорів зі Стефаном Баторієм.
Кубок зроблений з венеціанського скла, тому він легкий і витончений, у руках швидко теплішає, і синій колір його нагадує колір сапфіра. А камінь цей, як зазначали російські лечебник, робить «людину спокійною, чесним, побожним і милосердним». Іван Грозний, за відомостями згадуваного вище Д. Гарсея, дуже любив сапфіри, називав їх «покровителями милосердя і ворогами пороку». Золота смужка по краю кубка місцями стерлася, як це буває від частого використання. Ймовірно, подарунок подобався російському царю, і в день поховання чиясь рука поставила кубок поруч з покійним ...
Останки синів Івана Грозного - убієнного царевича Івана і царя Федора Іоанновича - були загорнуті в шовкові покривала з камки і сповитий тасьмою. Роки правління царя Федора Іоанновича здавалися часом тихим і безтурботним: цар ні в що не втручався, їздив на прощі, відстоював довгі церковні служби і навіть телефонував на дзвіницях. Він і мав славу царем «освятованним», які готуються до кончини і майбутнього вічного життя. Здавалося, він мав би перед кончиною постригтися у ченці, а він лежить у труні у мирському плаття - в каптані, підперезаний ременем. Мабуть, раптова смерть завадила царя вступити на дорогу вічного блаженства, що частково підтверджується і написом на його гробниці. Вона говорить, що цар Федір Іоаннович помер 6 січня 1598 року, а похований 8 січня. Напис робив майстерний різьбяр, всі букви вирізані красиво і чітко, але майстер, мабуть, поспішав і не докінчив букву «б» у слові «благочестивий». І вийшов цар названим «глагочестівим». Забракло часу і для підбору дорогого кубка для миро, і в гробниці царя був встановлений непристойно простий для царственої особи кубок.