І.В. Смирнов, Рязанський державний медичний університет ім. академіка І. П. Павлова
Розширення спектру збудників бактеріальних інфекцій людини, різноманіття їхніх властивостей і неоднакове медичне значення потребують поглиблення знань про бактеріях, що беруть участь у розвитку інфекційних процесів. Ці знання необхідні для формування науково обгрунтованої лікарської тактики при класичних і опортуністичних інфекціях, особливо на початковому (долабораторном) і кінцевому (інтерпретація) етапах мікробіологічної діагностики, а також при виборі засобів етіотропного лікування і специфічної профілактики. У зв'язку з цим актуальним видається ознайомлення лікарів та іншого медичного персоналу з особливостями збудників сучасних бактеріальних інфекцій, принципами їх класифікації та номенклатури.
Представлені матеріали містять відомості про систематичне положення збудників бактеріальних інфекцій, їх патогенності і вірулентності у світлі практичних питань, що визначають тактику діагностики, лікування і профілактики бактеріальних інфекцій.
Введення
Прогрес в галузі клінічної мікробіології та інфектології в останні десятиліття розширив наші уявлення про відомих збудників інфекційних хвороб і дозволив виявити ряд раніше невідомих інфекцій людини.
У зв'язку з істотним розширенням спектру збудників і нерідко переглядом ролі деяких з них у виникненні, розвитку і поширенні інфекцій для практики все більш актуальним стає питання про застосування адекватних методів і засобів виділення і точної ідентифікації збудника конкретного захворювання, а також адекватних засобів етіотропної терапії та профілактики .
Успіх класичних методів виявлення збудника інфекції залежить від правильного вибору виду і кількості досліджуваного матеріалу, часу і техніки його відбору, умов транспортування, обробки, підбору методів і засобів виділення та ідентифікації збудника. У кожному конкретному випадку вони визначаються властивостями збудника, характером і стадією інфекції.
Слід підкреслити, що кінцевий результат дослідження залежить не тільки (а іноді і не стільки) від компетентності і адекватних дій мікробіолога, але і від грамотності дій тих фахівців, які мають відношення до досліджуваного матеріалу на долабораторном етапі.
Не менш важливе значення має правильна інтерпретація лікарями результатів мікробіологічного аналізу, що також вимагає достатніх знань про властивості збудників інфекцій людини. Різноманіття збудників бактеріальних інфекцій не повинно бути перешкодою на шляху раціонального контролю за хворобами цієї групи.
Принципи класифікації бактерій
Незважаючи на широку поширеність вірусних інфекцій, бактерії залишаються найбільш часто розпізнаваними етіологічними агентами інфекційних захворювань. У зв'язку з цим видаються важливими питання таксономії бактерій - їх опису, назви та ідентифікації.
Взаємозв'язок цих понять схематично представлена на рис.1 [1].
Рис. 1. Взаємозв'язок між описом, класифікацією і номенклатурою в таксономії прокаріотів [1].
Біологічна класифікація бактерій неодноразово переглядалася. Але лише сучасна класифікація, представлена в Посібнику по систематиці бактерій Берджі, містить чіткі вказівки про медичне значення представників конкретних таксонів [2].
Бактерії представляють в порівнянні з вірусами більш високий (клітинний) рівень організації. Вони входять до Надцарство прокаріотичних (одноклітинних, "доядерние") мікроорганізмів, для яких характерні:-геном у вигляді кільцеподібно замкнутої двухспіральной молекули ДНК, що лежить безпосередньо в цитоплазмі клітини;-амітотіческое бінарне розподіл;-розміри в межах 0,3-2 мкм; -рибосоми 70S;-відсутність мітохондрій, ендоплазматичної сітки, комплексу Гольджі і хлоропластів;-наявність пептидоглікану в клітинній стінці;-широкий спектр варіантів метаболізму і виражені адаптаційні властивості.
Деякі види утворюють покояться форму - ендоспори (спору).
Основою визначення систематичного положення є: морфологія і тинкторіальні властивості клітин (форма, розміри, взаємне розташування, спорообразование, забарвлення за Грамом та іншими методами), культуральні, біохімічні, антигенні характеристики, а також чутливість до різних антимікробних впливів і ступінь генетичної спорідненості з представниками інших таксонів (за процентним співвідношенням змісту гуаніну і цитозину в геномі, гомології нуклеїнових кислот і здатності до обміну генетичною інформацією).
За рівнем біологічної організації бактерії стоять нижче еукаріотичних організмів (грибів, найпростіших, гельмінтів), для яких характерне оформлене ядро, набір лінійних хромосом з диплоїдним набором генів, мітотичний поділ, статеве розмноження, що супроводжується мейозом і кросинговером, розміри більше 2 мкм, рибосоми 80S, мітохондрії, ендоплазматична мережа, комплекс Гольджі, відсутність ендоспори [3].
Незважаючи на введення нових методів таксономічних досліджень, питання про повну та всеохоплюючої класифікації бактерій залишається до кінця невирішеним. Навіть справжнє спорідненість, виявлене за гомології нуклеїнових кислот, свідчить лише про наявність загального предка і може бути оскарженого.
Найбільше практичне значення мають схеми ідентифікації, засновані на морфофізіологічні, тинкторіальних, метаболічних та інших легко виявляються властивості бактерій (рис.2) [4]. Визначення цих властивостей у ході діагностики дозволяє не тільки виділяти та ідентифікувати чисті культури, а й диференціювати їх з представниками супутньої мікрофлори, не пов'язаними із захворюванням. Більш того, навіть початкові етапи дослідження можуть дати цінну інформацію для вибору засобів етіотропної терапії.
Рис. 2. Приклад ідентифікації невідомого мікроорганізму класичними мікробіологічними методами [4].
Морфологія і тинкторіальні властивості. За морфологічною принципом бактерії поділяють на кулясті (коки), паличкоподібні (овоїдні, коккобацілли, прямі, вигнуті, вібріони, з закругленими, загостреними, "обрубаними" кінцями, розгалужені, нитки) і покручені форми (спіралеподібні з одним або більше завитками). Залежно від розташування в мікропрепараті розрізняють одиночні, попарно розташовані клітини (диплококи), у вигляді тетрад (тетракоккі), ланцюжків (стрептококи, стрептобацили), пакетів (сарцини), безладних скупчень (стафілококи).
Тинкторіальними властивостями називають здатність сприймати барвники і характерно фарбуватися. Найбільше значення для ідентифікації має використання складних (дифференцирующих) методів, в першу чергу методу Грама, що дозволяє розрізнити грампозитивні і грамнегативні бактерії. При фарбуванні цим методом грампозитивні бактерії забарвлюються у синьо-фіолетовий колір, а грамнегативні-в бордово-червоний, що відображає відмінності в будові клітинних стінок бактерій двох груп.
На підставі результатів мікроскопії пофарбованих за методом Грама препаратів з патологічного матеріалу можна орієнтовно судити про склад мікрофлори і ступеня мікробного обсіменіння матеріалу, що дозволяє вибрати більш адекватні методи і засоби діагностики і початкової антимікробної терапії. Так, наприклад, при виявленні стрептококів препаратом вибору повинен бути пеніцилін [5]. Результати паралельного виділення та ідентифікації збудника з подальшим визначенням чутливості уточнюють зроблений вибір.
З інших методів часто використовують забарвлення за Цілем-Нільсену, що дозволяє виявити кислотостійкі форми бактерії (Mycobacterium spp., Nocardia spp.) І суперечки (покояться форми). Наприклад, мікобактерії туберкульозу забарвлюються в червоний колір, а некіслотоустойчівие клітини-у синій.
За наявності особливих (необов'язкових) структурних елементів розрізняють бактерії:-спороутворюючі (Clostridia spp., Bacillus spp.) Та аспорогенні (ентеробактерії та ін);-капсульованих (Klebsiella spp., S.pneumoniae, B.anthracis та ін); -бескапсульние (Vibrio spp., Brucella spp. та ін);-рухливі (утворюють джгутики), наприклад багато грамнегативні палички;-нерухомі (багато коки).
Метаболічні властивості. Особливості конструктивного і енергетичного метаболізму бактерій дозволяють виділити кілька груп за типами живлення і біологічного окислення (дихання). Розрізняють бактерії:-за типами засвоєння вуглецю - гетеротрофи (використовують вуглець органічних сполук) і аутотрофи (використовують вуглець неорганічних сполук);-за типами дихання - аероби (ростуть на повітрі), анаероби (ростуть у безкисневому середовищі), факультативні анаероби (ростуть як за відсутності, так і в присутності кисню), мікроаерофіли (ростуть при зниженому парціальному тиску кисню), капнофіли (ростуть при підвищеному парціальному тиску вуглекислого газу).
Мікроорганізми, що використовують для отримання енергії як джерела електронів органічні сполуки, називають хемоорганотрофамі, неорганічні сполуки-хемолітотрофамі.
Оскільки розщеплення глюкози - універсального джерела енергії та органогенов-у бактерій може відбуватися різними шляхами, виділяють ферментують і неферментуючі бактерії. Для перших характерний бродильний тип метаболізму (перенесення електронів у безкисневому середовищі від джерела енергії тільки на органічні сполуки, синтезовані кліткою), для других-окислювальний (перенесення електронів через ланцюг "дихальних" ферментів на кисень з утворенням перекисних сполук).
Серед патогенних для людини переважають мікроорганізми з окислювальним або окислювальним і бродильним типом метаболізму (аероби і факультативні анаероби відповідно). Більшість клінічно значущих видів відносять до мезофіли-для них температурний оптимум зростання перебуває у межах 25-40oС (на відміну від псіхрофілов і термофіли, що мають відповідно нижчі або вищі значення оптимуму).
За здатністю рости на простих (універсальних) живильних середовищах (за типом мясопептонного бульйону або агару Хоттингера) розрізняють бактерії невибагливі (Staphylococcus spp., Ентеробактерії та ін) і примхливі (Streptococcus spp., Haemophilus spp., Neisseria spp. Та ін) .
Примхливі бактерії можуть рости тільки в присутності збагачують середу добавок (крові, її сироватки, дріжджового екстракту та ін), що містять фактори росту-гемін, вітаміни, амінокислоти, нуклеотиди, ліпіди. Бактерії, що залежать від тих чи інших факторів росту і нездатні синтезувати будь-які з'єднання з глюкози і солей амонію як єдиних джерел вуглецю та азоту, називають ауксотрофамі. Ауксотрофность характерна для багатьох патогенних бактерій.
Антигенна структура. За локалізацією, хімічною природою та фізико-хімічними властивостями у бактерій розрізняють антигени кількох типів:-термостабільний О-антиген (соматичний) представлений бічними полісахаридними ланцюгами ліпополісахариди клітинної стінки грамнегативних бактерій;-К-антиген (капсульний, або оболончатий) - термостабільними полісахаридами капсули або термолабільних білками зовнішньої мембрани грамнегативних бактерій, а також клітинної стінки і капсули грампозитивних бактерій;-Н-антиген (жгутиковий) - термолабільних білком, флагелліном джгутиків.
Відмінності в будові зазначених антигенів визначають приналежність до того чи іншого антигенною (серологическому) варіанту мікробного виду. Так, всередині виду E.coli налічують десятки серогрупп і сероварів, які мають спеціальні позначення, наприклад E.coli О157: Н7 (збудник геморагічного коліту з гемолітико-уремическим синдромом).
Патогенність і вірулентність. Як і в інших мікроорганізмів, бактеріальні види поділяють на безумовно-патогенні (збудники класичних інфекцій), умовно-патогенні або потенційно патогенні (збудники опортуністичних інфекцій) і непатогенні для людини (не мають медичного значення).
Якщо перші не зустрічаються у складі мікрофлори здорової людини і при попаданні в його організм, як правило, викликають розвиток інфекції, то другі часто виявляються у здорових людей і викликають інфекційний процес лише за особливих умов (дефект або загальне зниження антиінфекційної резистентності організму, масивність зараження і ін).
За ступенем небезпеки для людини і суспільства в нашій країні бактерії відносять до 4 груп (у порядку убування небезпеки):-I-збудник чуми;-II-збудники холери, сибірської виразки, бруцельозу та інших "особливо небезпечних інфекцій";-III-збудники туберкульозу, дифтерії, черевного тифу та інших класичних інфекцій;-IV-стафілококи, клостридії, протеї та інші збудники опортуністичних інфекцій [6].
У міру накопичення відповідної інформації приналежність видів до тієї чи іншої групи може переглядатися.
У залежності від фенотипической вираженості патогенного потенціалу конкретний представник (штам, клон, варіант) патогенного або умовно-патогенного бактеріального виду може бути високо-, помірно-або маловірулентних.
Вірулентність складається з патогенних властивостей штаму: адгезивності, інвазивності, персистентних характеристик, цитотоксичності, токсигенності і інших властивостей. Зміна вірулентності штаму може бути наслідком придбання або втрати факторів патогенності: капсули, білків адгезинів і інвазінов, токсинів та інших структур і речовин мікроба, які забезпечують виникнення і розвиток інфекції. На практиці при вирішенні питання про етіологічну або епідеміологічної значимості того чи іншого штаму нерідко доводиться враховувати вираженість його патогенних властивостей, наявність конкретних факторів патогенності і / або відповідних генетичних детермінант (наприклад, токсигенні і нетоксигенних дифтерійні палички, високо-і нізкоінвазівние ієрсинії).
Систематизація бактерій в Визначнику Берджі
Принципи ідентифікації, викладені в Визначнику бактерій Берджі, 9-е видання якого вийшло в 1994р. [7], знайшли найбільше поширення в практичній бактеріології. Відповідно до них (на основі будови клітинної стінки і відносини до фарбування за Грамом) бактерії розділені на 35 груп, що входять до 4 категорії: I - грамнегативні еубактеріі; II - грампозитивні еубактеріі; III - еубактеріі, позбавлені клітинної стінки - мікоплазми (Mollicutes) ; IV - археобактеріі (Archaea).
Патогенні для людини види відносяться до еубактеріі (I-III). У табл.1 наведено назви 14 груп, до яких відносять бактерії, що мають медичне значення [2, 7, 8, 9]. Далеко не всі представники перелічених пологів мають медичне значення. Тому на практиці необхідно враховувати не тільки родову і видову приналежність виділеного мікроорганізму, але в ряді випадків і патогенний потенціал штаму (наприклад, приналежність E.coli до певного патогенного варіантом), локалізацію його в організмі і ступінь обсемінено їм клінічного матеріалу.
У зв'язку з цим наводимо дані про частоту виявлення бактеріальних видів у різних біотопах організму людини та їх етіологічної значимості при відповідних локальних інфекціях (табл.2) [9]. Звичайно, ці відомості будуть уточнюватися в міру накопичення клінічних даних і результатів таксономічних досліджень.
Таблиця 1. Основні патогенні та умовно-патогенні для людини бактерії [2, 6, 9, 10, 11, 12].
Група (категорія) | Таксони | 1 (I) Спірохети | Пологи Treponema, Borrelia, Leptospira | 2 (II) Аеробні і мікроаерофільні, рухливі, спіральні і зігнуті грамнегативні бактерії | Пологи Campylobacter, Helicobacter, Spirillum, Wolinella | 4 (I) Грамнегативні, аеробні та мікроаерофільні палички та коки | Пологи Achromobacter, Acinetobacter, Agrobacterium, Afipia, Alcaligenes, Bartonella, Bordetella, Brucella *, Burkholderia *, Flaviomonas, Flavobacterium, Francisella *, Kingella, Legionella, Moraxela, Morococcus, Neisseria, Pseudomonas, Stenotrophomonas | 5 (I) Факультативно-анаеробні грамнегативні палички: сімейства ентеробактерій (1), вібріонів (2), пастерелл (3), і не віднесені до них пологи (4) | 1. Пологи Cedecea, Citrobacter, Edwardsiella, Enterobacter, Escherihia, Ewingella, Hafnia, Klebsiella, Kluyvera, Leclercia, Morganella, Pantoea, Proteus, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, Tatumella, Yersinia * 2. Пологи Aeromonas, Plesiomonas, Vibrio * 3. Пологи Actinobacillus, Haemophilus, Pasteurella 4. Пологи Calymmatobacterium, Capnocytophaga, Cardiobacterium, Chromobacterium, Eikenella, Gardenella, Streptobacillus | 6 (I) Грамнегативні анаеробні прямі, зігнуті і спіральні бактерії | Пологи Anaerobiospirrilum, Anaerorhabdus, Bacteroides, Bilophila, Fusobacterium, Porphyromonas, Prevotella | 8 (I) Анаеробні грамнегативні коки | Рід Veillonella | 9 (I) Рикетсії і хламідії: сімейства рикетсій (1) і хламідій (2) | 1. Coxiella *, Ehrlichia, Rickettsia * 2. Chlamydia, Chlamydophila | 17 (II) Грампозитивні коки | Пологи Aerococcus, Enterococcus, Gemella, Leuconostoc, Peptococcus, Peptostreptococcus, Staphylococcus, Streptococcus | 18 (II) Грампозитивні палички і коки, що утворюють ендоспори | Пологи Bacillus *, Clostridium | 19 (II) Не утворюють спор грампозитивні палички правильної форми | Пологи Erysipelothrix, Listeria | 20 (II) Не утворюють спор грампозитивні палички неправильної форми | Пологи Actynomyces, Arcanobacterium, Bifidobacterium, Corinebacterium, Eubacterium, Gardnerella, Lactobacillus, Mobiluncus, Propionibacterium, Rothia | 21 (II) Мікобактерії | Рід Mycobacterium | 22, 25, 26 (II) Актиноміцети | Пологи Actinomadura, Gordona, Nocardia, Oerskovia, Rhodococcus, Streptomyces, Tsukamurella | 30 (III) Мікоплазми (або молікутів) | Пологи Mycoplasma, Ureaplasma |
|
Примітка. Підкреслені пологи, що містять один або кілька безумовно-патогенних видів (варіантів).
* Відмічені пологи, до складу яких входить один або декілька збудників особливо небезпечних інфекцій.
Таблиця 2. Частота виявлення різних бактеріальних видів у матеріалі з різних біотопів тіла людини та їх етіологічне значення [9, сдополненіямі].
Бактерії | Частота виявлення та етіологічне значення * | РТ | Шлунково-кишкового тракту | МПТ | КР | Г | У | Achromobacter xylosoxidans | | | | | C 1 | C 2 | Acidaminococcus fermentans | | C 1 | | | | | Acinetobacter spp. | B 2 | | B 2 | B 2 | B 2 | | Actinobacillus actinomycetemcomitans | | | | | C 2 | | Actinomadura madurae | | | | C 2 | | | Actinomyces spp. | A 2 | | B 2 | B 2 | C 2 | | Aerococcus viridans | B 1 | | | | | | Aeromonas spp. | | B 2 | | B 2 | | | Agrobacterium tumefaciens | C 2 | | | C 2 | | | Alcaligenes spp. | | B 2 | C 2 | | | | Alloiococcus otitidis | | | | | | C 2 | Anaerobiospirillum succiniproducens | | c 2 | | | | | Arachnia propionica | B 1 | | | | | | Arcanobacterium haemolyticum | B 3 | | | C2 | | | Azotobacter spp. | | | | | C 1 | | Bacillus anthracis | C 3 | C 3 | | C 3 | | | Bacillus spp. | B 1 | B 2 | C 1 | B 1 | B 2 | | Bacteroides spp. | A 2 | A 2 | A 2 | B 2 | C 2 | C 2 | Bartonella spp. | | | | C 3 | | | Bifidobacterium spp. | B 1 | B 1 | C 1 | B 2 | C 2 | C 2 | Bilophila wadsworthia | | | C 2 | | | | Bordetella pertussis | B 3 | | | | | | Borrelia spp. | B 1 | | | | | | Brucella spp. | C 3 | | | | C 3 | | Calymmatobacterium granulomatis | | | C 3 | | | | Campylobacter spp. | B 1 | B 3 | C 2 | | | | Capnocytophaga spp. | B 2 | | | | | | Cardiobacterium hominis | B 1 | | | | | | Chlamydia psittaci | B 3 | | B 2 | | | | Chlamidia trachomatis | C 3 | | B 3 | | B 3 | | Chlamydophila pneumoniae | B 3 | | | | | | Clostridium spp. | B 2 | A 2 | A 2 | B 2 | C 2 | C 2 | Corinebacterium diphtheriae (токсигенні) | C 3 | | | C 3 | C 3 | C 3 | Corynebacterium spp. | B 1 | B 1 | B 2 | B 2 | B 2 | C 1 | Coxiella burnetii | C 3 | | | | | | Eikenella corrodens | B 2 | | | C 3 | | | Enterobacteriaceae | B 2 | A 2 | A 2 | B 2 | B 2 | B 2 | Enterococcus spp. | C 1 | A 2 | B 2 | B 2 | | | Erysipelothrix spp. | | | | C 3 | | | Eubacterium spp. | | A 1 | | B 2 | | C 1 | Flavobacterium spp. | C 2 | | C 2 | B 2 | | | Francisella tularensis | C 3 | | | | C 3 | | Fusobacterium spp. | A 2 | A 2 | B 1 | B 2 | C 2 | C 2 | Gardnerella vaginalis | | | B 2 | | | | Gemella spp. | B 1 | | | | | | Haemophilus influenzae | A 3 | | | | C 3 | B 3 | Haemophilus influenzae біоварIII (H.aegyptius) | | | | | B 3 | | Haemophilus ducreyi | | | B 3 | | | | Haemophilus spp. | A 2 | | | | | | Helicobacter pylori | | B 3 | | | | | Kingella spp. | C 2 | | | | | | Lactobacillus spp. | B 1 | A 1 | A 1 | | C 2 | | Legionella spp. | B 2 | | | | | | Leptospira interrogans | | | C 3 | | | | Leptospira spp. | | | | C 3 | C 3 | | Leptotrichia buccalis | B 1 | | | | | | Listeria spp. | | | C 2 | C 2 | | | Micrococcus spp. | A 1 | | | A 1 | | | Mobiluncus spp. | | | B 2 | | | | Moraxella catarrhalis | B 2 | | C 1 | | B 1 | B 2 | Moraxella spp. | B 1 | | B 1 | C 2 | B 2 | | Mycobacterium spp. | B 2 | B 2 | B 2 | B 2 | C 2 | C 2 | Mycobacterium tuberculosis | B 3 | | | | C 3 | | Mycoplasma hominis | | | B 2 | | | | Mycoplasma pneumoniae | B 2 | | | | | | Neisseria gonorrhoeae | C 3 | C 3 | B 3 | | B 3 | | Neisseria meningitidis | B 2 | | C 3 | | B 3 | | Neisseria spp. | A 1 | B 1 | B 1 | | B 1 | | Nocardia spp. | B 3 | | | C 2 | C 3 | | Pasteurella spp. | C 2 | | | C 2 | | | Pediococcus spp. | | C 1 | | | | | Peptococcus spp. | B 2 | A 1 | B 2 | C 2 | | C 2 | Peptostreptococcus spp. | A 2 | B 2 | B 1 | B 2 | C 2 | C 2 | Plesiomonas shigelloides | | C 2 | | C 2 | | | Porphyromonas spp. | A 2 | A 2 | A 2 | B 2 | | | Prevotella spp. | A 2 | A 2 | A 2 | B 2 | | | Propionibacterium spp. | | | B 1 | A 2 | B 2 | B 2 | Pseudomonas aeruginosa | B 2 | | B 2 | B 2 | B 2 | B 2 | Pseudomonas spp. | | B 2 | B 3 | B 2 | B 2 | | Rhodococcus spp. | C 2 | | | C 2 | | | Rickettsia spp. | C 3 | | | B 3 | | | Rothia dentocariosa | B 1 | | | | | | Ruminococcus bromii | | C 1 | | | | | Selemonas spp. | C 1 | B 1 | | | | | Spirillum minus | | | | C 3 | | | Staphylococcus spp. | A 2 | B 2 | A 2 | A 2 | A 2 | B 2 | Stenotrophomonas maltophilia | B 2 | | C 2 | B 2 | | | Stomatococcus mucilaginosus | B 1 | | | | | | Streptobacillus moniliformis | | | | C 2 | | | Streptococcus pneumoniae | B 2 | | | | C 3 | B 3 | Streptococcus pyogenes | B 2 | | | B 3 | | | Streptococcus spp. | A 2 | B 2 | B 2 | B 2 | B 2 | B 2 | Streptomyces somaliensis | | | | C 2 | | | Succinimonas spp. | | B 1 | | | | | Succinivibrio spp. | | B 1 | | | | | Treponema pallidum | | | B 3 | | B 3 | | Treponema spp. | B 2 | | | B 3 | | | Ureaplasma urealyticum | | | B 1 | | | | Veilonella spp. | A 1 | B 2 | | B 2 | C 2 | C 2 | Vibrio spp. | B 1 | B 2 | | C 2 | | C 2 | Wolinella recta | B 1 | | | | | |
|
Примітка. РТ-респіраторний тракт, шлунково-кишкового тракту-шлунково-кишковий тракт, МПТ-сечостатевої тракт, КР-шкіра і ранові відокремлюване, Г-очі, У-вуха; A-часто присутні в клінічному матеріалі, B-зрідка присутні в клінічному матеріалі, C- рідко присутні в клінічному матеріалі; 1 - рідко (якщо коли-небудь) мають етіологічне значення, 2 - іноді бувають причиною захворювання, 3 - зазвичай бувають причиною захворювання.
У відношенні системних інфекцій слід зазначити, що у здорових осіб кров, ліквор і внутрішні органи, не сполучені з зовнішнім середовищем, зазвичай стерильні, і виявлення тих чи інших бактерій у відповідному клінічному матеріалі зазвичай вважається клінічно значущим. Незважаючи на відсутність загальної закономірності в присутності тих чи інших бактеріальних видів, є спостереження, що свідчать про переважання в зазначених матеріалах певних мікроорганізмів при різних клінічних ситуаціях.
Так, з крові при лихоманці неясного походження нерідко висівають сальмонели, пневмококи, бруцели, менінгококи, пастерелл, лістерії, при бактеріальних ендокардітах - стрептококом, ентерококи, стафілококи, коринебактерії, у разі бактеріємії на 1-му тижні життя-Streptococcus agalactiae, E. coli і S.aureus, після травм або операцій на черевній порожнині - грамнегативні палички (ентеробактерії, облігатні анаероби кишечника, псевдомонади).
При менінгіті у лікворі крім менінгококів можуть бути виявлені пневмококи, Haemophilus influenzae, лістерії, сальмонели, збудники туберкульозу, у новонароджених при септицемії і менінгіті-S.agalactiae, грамнегативні палички і лістерії. При внутрішньочерепних абсцесах переважають анаероби (пептострептококи, бактероїди і близькоспоріднені бактерії, актиноміцети), а з аеробів частіше виявляються стрептококи [9].
Висновок
Питання класифікації і номенклатури бактерій важливі не тільки для фахівців в області таксономії, основним завданням яких є уточнення систематичного положення та філогенетичної близькості видів. Вони визначають практичні підходи до виділення і ідентифікації мікроорганізмів, що мають медичне значення, проведення адекватної антимікробної терапії та профілактики, забезпечують уніфікацію термінів і понять. Без цього неможливо ефективну взаємодію лікарів різних спеціальностей, що мають справу з проявами інфекційного процесу.
Список літератури
LengelerJ.W., DrewsG., SchlegelH.G., Editors. Biology of the Procaryotes. 1st ed. New York: Thieme; 1999.
HoltJ.G., Editor. Bergey `s manual of systematic bacteriology. 1st ed. Baltimor: Williams &Wilkins; 1986.
Медична мікробіологія. Гол. ред. В. І. Покровський, О. К. Поздєєв. М.: ГЕОТАР Медицина; 1998.
MadiganM.T., MartinkoJ.M., ParkerJ., Editors. Biology of microorganisms. 8thed. New Jersey: Simon &Schuster; 1997.
GilbertD.N., MoelleringR.C., SandeM.A., Editors. The Sanford guide to antimicrobial therapy. 29thed. Hyde Park: Antimicrobial Therapy, Inc.; 1999.
Порядок обліку, зберігання, передачі та транспортування мікроорганізмів I-IV груп патогенності. 1.2.Епідеміологія. Санітарні правила СП 1.2.036-95. М.: Госкомсанепіднадзор Росії; 1996.
HoltJ.G., Editor. Bergey `s manual of determinative bacteriology. 9thed. Baltimor: Williams &Wilkins; 1994.
Визначник бактерій Берджі. Під ред. Дж.Хоулта, Н. Крига, П. Сниться, Дж.Стейлі, С. Вільямса. 9-е изд. У 2 т. Пер. з англ. під ред. Г. А. Заварзіна. М.: Світ; 1997.
MurrayP.R., BaronE.J., PfallerM.A., TenoverF.C., YolkenR.H., Editors. Manual of clinical microbiology. 6thed. Washington, DC: ASM Press; 1995.
BrucknerD.A., ColonnaP., BearsonB.L. Nomenclature for aerobic and facultative bacteria. Clin Infect Dis 1999; 29:713-23.
ЕйдельштейнІ.А. Фундаментальні зміни в класифікації хламідій і споріднених їм мікроорганізмів порядку Chlamydiales. Клин Микробиол і антімікроб хіміотер 1999; 1:5-11.
BalowsA., TruperH.G., DworkinM., HarderW., SchleiferK.H., Editors. The Prokaryotes. 2nded. New York: Springer-Verlag; 1992.