Організація козацького війська
Головний центр козацької організації знаходився на дніпровському Низу, поза межами досяжності польської шляхти, влади і військ, і тут, на волі розвивалося козацький устрій. Центром є Запорізька Січ (Січа, Січ). Це була величезна і потужна фортеця, що переноситься то на той, то на інший з дрібних дніпровських островів. Земляні вали і дерев'яний частокіл зовні обвивав рів з водою. У фортечну систему зміцнення входили високі вежі з бійницями для гармат, мушкетів і рушниць. У затишних місцях переховував гармати і різні військові речі. Козацька артилерія була невелика, але відрізнялася великою справністю. Січ розпоряджалася козацькими силами, розкиданими на Запоріжжі і розселенням на волості. Посередині фортеці була велика площа, а в її центрі-церква Святої Покрови, неподалік стояв стовп, біля якого карали порушників закону Січі. У межах форту знаходилося 38 куренів, кожен мав свою назву в залежності від того, з якої місцевості були козаки, які проживали в цьому курячі. Поза Січі біля річкового порту знаходився "грецький дім", в якому жили закордонні посли і купці. Багато маленьких островів на Дніпрі утворили заплутані лабіринти, у глибині яких розміщувалося місце, яке козаки називали Січової скарбницею. У ній стояли козацькі судна (чайки), стояли гармати. Місце, розташування скарбниці, знали тільки кілька людей.
Основне озброєння козаків становили: мушкети, пістолети, які козаки завжди носили за поясом, шабля, бойові ножі, кинджали, келепи, спиці, багри, якими вони стягували вершників з коней.
Вся кількість козацького війська обчислювалася в 1590-х роках в 20 тисяч. Погром 1596 зменшив його чисельність, але з першим десятиліттям 17-го століття вона знову повертається до колишнього і продовжує потім зростати. Але більшість козаків проживало і господарювало "на волості"; на Низу весною і влітку знаходилося по кілька тисяч козаків, готуючи до походів або займаючись різними промислами: рибальством, полюванням, соляним промислом; вели також торгівлю з татарами і турками, у певних прикордонних містах. На зиму розходилися по різних місцях "волості" і мало хто залишався на зимівниках. Кілька сот козаків залишалося на Січі для охорони артилерії та військових припасів. Зимувати було нелегко-доводилося жити в куренях, де-не-як влаштованих з лози або дерева, і прозімовавшіе тут кілька зим вважалися особливо випробуваними і досвідченими товаришами.
Військо поділялося на полки. Офіційно вважалося на початку 17в. чотири полки і в кожному по 500 душ-стільки вважалося козаків на службі польського уряду. У дійсності і полків цих було більше, і козаків в них бувало неоднакове число-іноді по кілька тисяч (наприклад, у Хотинській війні козацьке військо мало 11 полків, і в деяких полках число доходило до 4 тисяч козаків). Полком правил полковник. Кожен полк має свій прапор, свого сурмача і Довбуш. Він поділяється на сотні, сотні на десятки чи інакше курені. Куренями правлять отамани, сотнями сотники. Різні доручення гетьмана виконує осавул. Артилерією завідує обозний, її місцеперебуванням вважається місто Терехтемирів з своїм старим монастирем, подарованим козакам Баторієм для притулку калік і для військових потреб; але так як він був занадто віддалений від Запоріжжя і занадто доступний для польської влади, то звичайно артилерія стояла ближче до Низу, а не в цій офіційної козацької столиці. Військовий канцелярією завідував писар. Папери від імені війська скріплювалися військової печаткою. У своїх листах військо зазвичай називає себе "військом Запорізьким", але часто вживає також такі позначення як "лицарство Запорізьке", або "лицарство війська Запорозького"; в уповноваження, даному козацьким послам для переговорів з імператором, військо називає себе "вільним військом Запорізьким" . Самі себе козаки називали "товаришами", а все військо "товариством". З польського боку козаків називали чемно "молойцамі" (молодцями), "панами молойцамі".
На чолі козацького війська стоїть виборний старшина, якого зазвичай називають гетьманом, часто і сам він іменують себе так в листах, не тільки в адресованих до своїх, але і до самого уряду, і навіть до короля. Уряд же зазвичай називає їх "старшинами": "старший війська Запорозького" таке, власне, офіційна назва козацького вождя. Хмельницький перший отримав офіційний титул гетьмана, і до нього цей титул офіційно належав лише головнокомандуючим польськими та литовськими військами.
Козаки дуже дорожили правом обирати собі старшого: це була основа козацького самоврядування. Щоправда, починаючи з першої реформи 1570г, уряд призначав від себе різних начальників над козацьким військом, але військо дивилося на них як на комісарів, призначених урядом для управління козаками, і до управління військовими своїми справами їх ніколи не допускав.
Усі найважливіші питання обговорюються усієї старшиною або "радою". Це зі уряд гетьмана, старшини і військової ради підкреслюється в прийнятих формулах військових атак, де виступає не один гетьман, а старшина і військо.
Морські походи. У козаків був дуже швидкий і маневрений флот, який складався з легких галер (козацьких чайок). Вражали особливо ті мізерні кошти, з якими козаки вступали в боротьбу з могутнім турецьким флотом. Ось що згадано в літописах про морської техніки козаків:
Перш за все висилають вони на Запоріжжі всякі приналежності,
необхідні для походу і для будівлі човнів, потім відправляються самі на Запоріжжі і займаються будівництвом човнів. За один човен приймаються чоловік шістдесят і виготовляють одну на два тижні тому що вони майстри на всі руки. Основою служить вербовий або липовий човен, довжиною в 45 футів, на нього набиваються з дощок борти так, що виходить човен в шістдесят футів довжини, 10-12 футів ширини і такої ж глибини. Кругом човен оточується валиком з щільно і міцно прив'язаних пучків очерету. Потім влаштовують два керма, ззаду і спереду, ставлять щоглу для вітрила і з кожної сторони по 10-12 весел.
Палуби в човні немає, і при хвилюванні вона вся наповнюється водою, але згаданий очеретяний валик не дає їй тонути. Таких човнів протягом двох-трьох тижнів 5 - 6 тисяч козаків можуть виготовити 80 - 100. У кожну човен сідало 50 - 70 осіб. На бортах човна зміцнюються 4-6 невеликих гармат. У кожному човні квадрант (для визначення напрямку шляху). У бочках провіант-сухарі, пшоно, борошно.