Мабуть, розрив між новим фараоном, його новаторським мистецтвом і культом нового бога Йота, з одного боку, і фиванским жрецтвом і древніми традиціями - з іншого, з плином часу поглиблювався. На шостому році свого правління Амен-хотп IV переносить свою резиденцію в нову, щойно збудовану їм столицю Ай-йот (в пер. «Небокрай сонця») [3, c.5-7], на північ від Фів, на східному березі Ніла, де ніщо не нагадувало новому фараона ні бога Амуна, ні його «багатого і гордовитого жрецтва» [1, c.31]. Тут все було пронизане культом нового бога - Йота. Саме з часу перенесення столиці в Ай-йот (приблизно 1348 до н. Е..) Не тільки імена старих богів, але самі слова «боги», «бог» перестали з'являтися на Солнцепоклоннические пам'ятниках, а часом навіть винищувалися в колишніх написах. Фіви прийшли в запустіння, в скарбницю Амуна перестали надходити будь-які доходи.
Завдяки тому, що Амен-хотп IV будував свою столицю на чистому місці, зараз досить легко відновити схему розміщення будівель в Ель-Амарне. Так, важливі будівлі в Ай-йот розташовувалися по обидва боки Королівського Шляху (Royal Road). Найбільше з будівель - грандіозний храм Йота, основне святилище якого знаходилося повністю під відкритим небом. Недалеко від Великого Храму (Great Temple) Йота був палац і простора резиденція королівського сімейства [9, Amarna]. Також варто відзначити «південний палац», ізглаженние написи в якому допомогли вченим дізнатися про існування Кейе, побічної дружини Амен-хотпа IV.
Більшість будівель в Ель - Амарна будувалися з нічим не скріплених обтесаних каменів, поверхня яких (стіни, підлоги і т. п.) була прикрашена зображеннями в живій натуралістичному стилі; практично в кожному великому будову були зображення сцен із життя сімейства Ех-не-йота .
У Ай-йот навколо фараона з'явилася і остаточно утвердилася нова бюрократія і нове жрецтво, жрецтво бога Йота. Зауважу, що новаторство Амен-хотпа IV проявилося і в самій структурі служіння: якщо раніше зберігачем і розповсюджувачем віровчення виступало жрецтво, то в період правління Ех-не-йота фараон сам став загальним вероучителя і провісником нової віри: «Немає іншого, хто знав би тебе (мається на увазі йот), окрім сина твого Нефрит-шепр-ре Ван-ре »,« Я (від імені Ех-не-йота) син твій благий для тебе, возносить ім'я твоє. Сила твоя, міць твоя залишаться в серці моєму »[4, c. 247-248]. Крім свідоцтв про самоличности служінні Амен-хотпа IV Йоту передбачається, що він сам був верховним жерцем свого бога протягом кількох місяців у 3-4гг. царювання, можливо, до пошуку для відповідного особи на цю посаду. Тобто, мабуть, був період, коли релігія не тільки об'єктивно, але навіть формально виходила від однієї людини - самого фараона.
Суворе «єдинобожжя», замінило стародавній політеїзм, було встановлено в країні фактично з волі царя, в силу його авторитету та реальної влади. Навіть на околиці країни, в найвіддаленіших храмових угіддях, слідували столичним заходам. Але, так як різка зміна релігії було підготовлено більше суб'єктивними, ніж об'єктивними факторами, не мало під собою реальної підтримки населення, то природно, що після смерті Амен-хотпаIV на 17-му році правління культ Йота швидко віддається забуттю, сам Ех-не- йот оголошується «бунтівником», позиції колишніх богів (і перш за все Амуна) відновлюються. Юний Тут-анх-йот (в пер. «Подібний (тобто такий, як належить) життям йот»), почавши керувати в Ай-йот, раптово переносить столицю знову до Фів, фактично відмовляється від Йота, прийнявши ім'я Тут- анх-Амун, а потім помирає «загадковою смертю» у віці близько 18-ти років. У так званій «реставраційної» написи Тут-анх-Амуна сказано, що в результаті правління Ех-не-йота країна була в повному занепаді, що від неї відвернулися боги, бо храми богів і богинь, починаючи від Елефантини і аж до мочарів Дельти, віддані були забуттю [1, c.31]. Ай-йот, місто Амен-хотпа IV, спіткала доля не краща, ніж того, хто його спорудив. Хоремхеб, колишній союзник фараона-«єретика», проклинає пам'ять колишнього володаря і розоряє Ай-йот, руйнуючи і гробницю Ех-не-йота. Пізніше кам'яні блоки з храмів колись блищала пишністю сонячної столиці Рамсес II буде використовувати для будівництва в Гермополисе.