На початку I тисячоліття до н.е. на території північного Ірану сформувалася держава Мана (зі столицею Зірта), яке згодом значно розширило свої межі, до середини 7 ст. до н.е. йому належала частина території сучасного Азербайджану. У першій половині 7 ст. до н.е. на південь від Каспійського моря утворилася держава Мідія (зі столицею Екбатани), яке підкорило Ману, в союзі з Виявлений знищило Ассірійська держава і завоювало Урарту. У 6 в. до н.е. Мідія була завойована Персією. При перською правителя Атропат (4 ст. До н.е.) вона називалася Мидийской Атропатену, або просто Атропатену, від якого, згідно з однією з версій, походить сучасна назва держави Азербайджан. Згідно з іншою версією, перське слово «Азері» означає вогонь, а Азербайджан можна перекласти як «Земля вогнів (або вогнепоклонників)». Пізніше територія країни входила до складу племінного об'єднання Кавказька Албанія, яка була до 4 в. н.е.
З 387 н.е. до середини 7 ст. Кавказька Албанія перебувала під владою сасанідского Ірану, а пізніше - Арабського халіфату. У 8-11 ст. посилився вплив кочових тюркських племен, що змішуються з місцевим населенням і що зробили вплив на мову, культуру та політику держави. Перська мова корінного населення поступово був витіснений тюркським діалектом, з якого з часом сформувався самостійний азербайджанську мову. У 13 ст., Після завоювання монголами, Азербайджан увійшов до складу держави Хулагуїдів і знаходився під їх владою до другої половини 14 ст. В кінці 14-15 ст. цього території утворилася держава Ширван. У 15 ст., Після навали Тімура, Азербайджан перейшов під владу туркменів, які заснували два змагалися держави - Кара-Коюнлу і Ак-Коюнлу.
На початку 16 ст. Азербайджан став оплотом місцевої династії Сефевідів, яка шляхом завоювань і енергійної політики централізації створила нове велике перське держава від Сирдар'ї до Євфрату зі столицею Тебріз. Шах Ісмаїл I (правив у 1502-1524) оголосив шиїзм державною релігією, що віддалило азербайджанців від тюрків-сельджуків. При Сефевідах Азербайджан часто ставав полем битв у війнах між шиїтської Персією та сунітської Туреччиною. Через загрозу османських вторгнень столиця Сефевідів була перенесена з Тебріза в Казвін, а пізніше в Ісфахан. Азербайджан, будучи стратегічно важливою провінцією, управлявся губернатором, який зазвичай суміщав цю посаду з вищим військовим званням сепахсалара. Азербайджан залишався під владою Персії аж до початку 18 ст. У 1723 російські війська окупували Баку і прикаспійські землі на південь від нього, аж до Решта. Однак більшу частину Азербайджану захопила Туреччина. За договором Туреччини і Росії 1724 (Стамбульський світ), до складу Росії увійшли прикаспійські області, включаючи Баку, Сальяни і Ленкорань, інша частина Азербайджану відійшла до Туреччини.
Боротьбу Персії з Туреччиною за повернення перських земель очолив полководець Надір. У 1734 він відвоював у турків Гянджа, а в 1735 підписав з Росією договір про передачу Персії прикаспійських земель. У 1736 Надір став шахом Персії, а після його вбивства в 1747 на території Персії, на північ від р.Аракс, утворилися 15 самостійних ханств, у тому числі Карабахське, Шекінська, Ширванське, Бакинське, Гянджинське, Кубинське, Нахічеванське, Дербентское і Літні Олімпійські ігри. Друга половина 18 ст. відзначена суперництвом Туреччини і Персії, політичною роздробленістю і міжусобицями, полегшити проникнення Росії в Закавказзі. Виклик цьому процесу був кинутий Персією, що підсилилася при шахський династії Каджарів. Перша російсько-перська війна (1804-1813) закінчилася Гюлістанський світом (1813), за яким до Росії відійшли Карабахське, Гянджинське, Шекінська, Ширванське, Кубинське, Дербентское, Бакинське і Літні Олімпійські ігри ханства, а також Західна Грузія (Імеретія і Абхазія) і Дагестан . Друга війна (1826-1828), в якій Росія також здобула перемогу, завершилася Туркманчайського світом (1828), за яким до Росії відійшли великі ханства - Нахічеванське і Ериванське, а Азербайджан був розділений між Персією і Росією. Кордон пройшла за р.Аракс.
У другій половині 19 ст. почався швидкий економічний розвиток російського Азербайджану. У 1848 р. була пробурена перша нафтова свердловина на родовищі Бібі-Ейбат, у 1859 в Сураханах був побудований перший нафтоперегінний завод, в 1863 - перший гасовий завод. У 1868 було налагоджено телеграфне сполучення між Баку і Тифлісом, а в 1883 - залізничне сполучення. У 1897 почалося будівництво нафтопроводу Баку - Батумі. Баку перетворився на культурний і промисловий центр Азербайджану: у 1870-і роки відкрилися азербайджанський національний театр, реальне і нафтове училища, в 1894 була заснована перша азербайджанська бібліотека, потім було відкрито перше жіноче училище і побудована текстильна фабрика.
На початку 20 ст. продовжується швидке зростання Баку, на частку якого в той час припадало 50% світового видобутку нафти і 95% нафтовидобутку Росії.
У 1911 була заснована найбільш велика нелегальна політична партія «Мусават». Кількість її членів істотно збільшилася після 1917. Найважливішими складовими мусаватістской ідеології були світський націоналізм і федералізм (азербайджанська автономія в рамках більш великої держави). Права і ліва фракції партії розходилися по ряду питань, зокрема з земельної реформи. Очолював «Мусават» М. Е. Расулзаде, поділяв погляди лівої фракції.
Перша незалежна республіка. Бакинський рада робітничих депутатів 15 листопада 1917 проголосив радянську владу в Баку. До весни 1918 радянська влада була встановлена не тільки в Баку і на Апшеронському півострові, але і в деяких прибережних повітах Азербайджану. До керівництва прийшов Бакинський рада народних комісарів на чолі зі Степаном Шаумяном. Однак протрималася радянська влада всього кілька місяців.
Мусаватістскій Тимчасовий Національна Рада Азербайджану 28 травня 1918 проголосив незалежну Азербайджанську Демократичну Республіку (АДР) зі столицею в Гянджі. Республіка проіснувала 23 місяці, при цьому з травня по жовтень 1918 була окупована Туреччиною, а з листопада 1918 по серпень 1919 - Великобританією. Туреччина, яка приєдналася в 1914 до австро-німецького блоку, наприкінці жовтня 1918 капітулювала перед військами Антанти. Британські війська в серпні зайняли Баку, а у вересні розпустили Бакинський Рада народних комісарів. Після цього менш ніж за рік у республіці змінилося п'ять урядів; всі вони були сформовані партією «Мусават» в коаліції з іншими партіями. Прем'єр-міністром перших трьох урядів був Фаталі Хойському (Хан-Хойському), останніх двох - Насіб Юсуфбеков. Главою держави вважався заочно обраний 7 грудня 1918 голова парламенту О. М. Топчібашев. На цій посаді він представляв Азербайджан на Паризькій мирній конференції 1919-1920. Виживання незалежного Азербайджану після виведення британських військ в серпні 1919 повністю залежало від результату громадянської війни в Росії. Навесні 1920 перемога виявилася на боці Червоної Армії, і 28 квітня 1920 її частини вступили до Азербайджану. У той же день було сформовано радянський уряд Азербайджану на чолі з Наріманов Наріманова.
Радянський період. Історія радянського Азербайджану почалася з придушення збройних заколотів. У грудні 1922 Азербайджан, Грузія і Вірменія утворили тимчасове державне об'єднання - Закавказьку Соціалістичну Федеративну Радянську Республіку (ЗСФРР), яка 30 грудня 1922 увійшла до складу СРСР.
У 1930-і роки в СРСР почалися масові чистки, у яких брав участь перший секретар ЦК і Бакинського комітету КП (б) Азербайджану М.Дж.Багіров. У 1936 ЗРФСР була розпущена, а Азербайджанська Радянська Соціалістична Республіка була включена до складу СРСР як самостійна республіка. Азербайджанські турки стали офіційно називатися азербайджанцями, їхній національний мова отримала назву азербайджанського.
Друга світова війна
Німецькі війська, що вторглися в СРСР під час Другої світової війни, в липні 1942 вийшли до Великого Кавказького хребта, але так і не вступили на територію Азербайджану. Багато азербайджанці билися в Червоній Армії. Введення частин радянської армії на територію Ірану сприяв відродженню паназербайджанскіх настроїв та ідеї об'єднання Іранського і Радянського Азербайджану. Під тиском західних держав Радянський Союз змушений був вивести свої війська за р.Аракс.
Післявоєнний період
У післявоєнні роки сталінська політика репресій була продовжена. Хрущовська «відлига» (1955-1964) була періодом ослаблення контролю в галузі літератури і в суспільному житті. У той же час ця епоха ознаменувалася нової антиісламської кампанією та політикою «зближення націй», яке повинно було привести до злиття всіх народів СРСР в «нову історичну спільність» - радянський народ.
Криза нафтової галузі в 1960-ті роки призвело до скорочення інвестицій в економіку Азербайджану. У 1969 Союзні влади призначили першим секретарем ЦК Комуністичної партії Азербайджану Гейдара Алієва. У 1982 Алієв став членом Політбюро ЦК КПРС, а в 1987 повернувся до Азербайджану.
Революція в сусідньому Ірані (1978) сприяла відродженню ісламізму в Азербайджані. У відповідь на зростання іранського впливу був знову висунуто гасло «Єдиного Азербайджану». У 1988 почали з'являтися незалежні видання і політичні організації. Із цих організацій найпотужнішою виявився Народний фронт Азербайджану (НФА).
У січні 1990 в НФА стався розкол між консервативно-ісламістським і помірним течіями. Більшість лідерів НФА були арештовані. На альтернативних виборах, проведених у вересні 1990, комуністи отримали ок. 90% голосів і були звинувачені у фальсифікації результатів виборів.
Незалежний Азербайджан
Після провалу спроби державного перевороту 1991 (ГКЧП) Верховна Рада республіки 30 серпня 1991 проголосив незалежність Азербайджану. Потім був розпуск Комуністичної партії Азербайджану. У вересні 1991 останній керівник ЦК КП Азербайджану Аяз Муталиб був обраний першим президентом республіки. Його підтримував обраний у вересні 1990 Верховна Рада, більшість місць в якому займали представники компартії. Опозиційні партії створили альтернативний орган влади - Національна рада.
18 жовтня був прийнятий конституційний акт про державну незалежність Азербайджану, схвалений 95% громадян, які взяли участь у референдумі 29 грудня 1991.
Тим часом розгорівся конфлікт в Нагірному Карабасі. На початку 1992 була проголошена незалежність Нагірного Карабаху. У послідувала за цим війні між Вірменією та Азербайджаном перевага виявилася на боці вірмен. Невдачі в Нагірному Карабасі послужили причиною відставки Муталібова, який був зміщений у березні 1992.
У червні 1992 на президентських виборах був обраний Абульфаз Ельчібей, лідер націоналістично налаштованої групи опозиційних партій і, зокрема НФА, колишній дисидент та політв'язень, за якого було віддано більше 60% голосів. Ельчібей виступав проти членства Азербайджану в СНД, за зближення з Туреччиною і розширення зв'язків з іранськими азербайджанцями.
Зниження життєвого рівня громадян, поразка азербайджанських військ в Нагірному Карабасі, невдалі рішення Ельчібея в галузі внутрішньої та зовнішньої політики, які поставили республіку на грань громадянської війни та економічного хаосу, викликали невдоволення населення. На початку червня 1993 в Гянджі під керівництвом полковника Сурета Гусейнова було піднято заколот. Влада в Баку перейшла до Алієва, який швидко зміцнив свої позиції. Офіційно Ельчібей був усунутий від посади президента референдумом, проведеним у серпні. У жовтні 1993 президентом Азербайджану був обраний Алієв, який в 1998 був переобраний на другий термін.
У жовтні 1994 прем'єр-міністром Суретом Гусейновим і силами Загону поліції особливого призначення (ОПОН) під керівництвом братів Ровшана і Махіра Джавадових була зроблена спроба державного перевороту. Повторну невдалу спробу перевороту брати Джавадови за допомогою ОПОН МВС Азербайджану та за підтримки опозиції зробили в березні 1995.
За прогнозами, в 21 ст. Азербайджан буде відігравати істотну роль у поставках енергоносіїв на світовий ринок. В даний час азербайджанська нафта надходить до чорноморських портів за двома нафтопроводами, які мають пропускну спроможність у 25 млн. т на рік. Один з них, північний, протягнуть через територію Росії в Новоросійськ, другий, західний, йде через територію Грузії до терміналу поблизу порту Супса. Прийнято рішення про будівництво нафтопроводу від Баку через Тбілісі і до турецького порту Джейхан на узбережжі Середземного моря. У той же час територія Азербайджану є важливим транзитним шляхом для транспортування нафти з Закаспійської регіону. У 1997 танкерами через Каспійське море і далі залізницею через територію Азербайджану було перевезено бл. 2 млн. т нафти.
Іншою важливою проблемою є розділ ресурсів Каспійського моря. 6 липня 1998 президенти Росії та Казахстану підписали в Москві угоду про розподіл ресурсів північного сектора Каспійського моря. На порядку денному стоїть питання про досягнення угоди на рівні глав усіх п'яти держав, що мають вихід до Каспійського моря, - Росії, Азербайджану, Туркменістану, Казахстану та Ірану.
12 січня 2003 в Клівлендської клініці (США, шт. Огайо) у віці 80 років помер колишній президент Азербайджану Гейдар Алієв (1923-2003).